La Asamblea Departamental del Guaviare mediante la ordenanza No. 010 del 18 de noviembre de 1993, expide el Estatuto Básico y Estructura orgánica de la Contraloría Departamental del Guaviare. La Contraloría inició a desarrollar su actividad misional en noviembre de 1993, el primer contralor fue el Doctor Libardo Hernández, también han sido Contralores:
- Dra. Martha Lucia Londoño Quiza
- Dr. Jairo Renfigo Narvaez
- Dr. Carlos Noé Carrillo Gutiérrez
- Dra. Yolanda Bustos Castro
- Dr. Carlos Noe Carrillo Gutiérrez
- Dr. Eulises Reyes Díaz
- Dr. Víctor Manuel Soto Muñoz
- Dr. Fernely Bravo Prada
- Dr. Hernando Moreno Sanabria
- Dr. Jaime Londoño Flórez
Y en la Actualidad el Dr. JUAN PABLO RAMIREZ PALACIO